CY3-假尿苷 花青素-假尿苷 Cy3-Pseudouridine
產(chǎn)品名稱(chēng):CY3-假尿苷 花青素-假尿苷 Cy3-Pseudouridine
產(chǎn)品描述:
CY3-假尿苷 花青素-假尿苷 Cy3-Pseudouridine
CY3-假尿苷(Cy3-Pseudouridine)是一種將經(jīng)典橙紅色熒光染料Cy3(花青素類(lèi)熒光染料)與核苷修飾分子假尿苷(Pseudouridine, Ψ)通過(guò)化學(xué)方法偶聯(lián)而成的功能化核苷探針。該產(chǎn)品兼具Cy3優(yōu)良的光學(xué)性能與假尿苷在RNA結(jié)構(gòu)與功能研究中的重要生物學(xué)意義,廣泛應(yīng)用于RNA標(biāo)記、核酸結(jié)構(gòu)研究、翻譯調(diào)控機(jī)制分析以及細(xì)胞成像等分子生物學(xué)與生物化學(xué)領(lǐng)域。
一、產(chǎn)品背景與原理
假尿苷(Pseudouridine,Ψ)是早被發(fā)現(xiàn)的RNA修飾核苷之一,廣泛存在于tRNA、rRNA、snRNA及mRNA中。與尿苷不同,假尿苷通過(guò)C-C糖苷鍵與核糖連接,具有更高的氫鍵供體能力,可增強(qiáng)RNA結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性并參與調(diào)控翻譯效率。近年來(lái),隨著RNA修飾研究的興起,假尿苷在mRNA疫苗與RNA**技術(shù)中的作用受到廣泛關(guān)注。
CY3是一種常用的花青素(Cyanine)類(lèi)熒光染料,具有較高的摩爾消光系數(shù)和良好的光穩(wěn)定性。其大激發(fā)波長(zhǎng)約為550 nm,發(fā)射波長(zhǎng)約為570 nm,呈現(xiàn)明亮的橙紅色熒光。CY3-假尿苷通過(guò)在假尿苷分子適當(dāng)位置引入連接臂,再與Cy3熒光基團(tuán)偶聯(lián),使其既可參與核酸合成或修飾,又可實(shí)現(xiàn)熒光可視化。
該探針可在體外轉(zhuǎn)錄體系或化學(xué)合成RNA過(guò)程中引入,用于構(gòu)建帶熒光標(biāo)記的假尿苷修飾RNA分子,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)RNA定位、追蹤及功能分析。
二、產(chǎn)品特點(diǎn)
高亮度熒光信號(hào)
CY3染料具有高量子產(chǎn)率和較強(qiáng)光穩(wěn)定性,適用于共聚焦顯微鏡、熒光顯微鏡及流式細(xì)胞儀檢測(cè)。
生物相容性良好
假尿苷為天然RNA修飾成分之一,其結(jié)構(gòu)與天然核苷相似,可較好融入RNA分子中而不顯著影響二級(jí)結(jié)構(gòu)。
多平臺(tái)適用
可用于體外轉(zhuǎn)錄、RNA體外修飾、核酸探針構(gòu)建、RNA-蛋白相互作用分析等實(shí)驗(yàn)。
信噪比高
橙紅色發(fā)射波段避開(kāi)多數(shù)細(xì)胞自發(fā)熒光區(qū)域,提高檢測(cè)靈敏度。
可進(jìn)行多色成像
Cy3與Cy5、FITC等熒光染料光譜分離良好,適合多重標(biāo)記實(shí)驗(yàn)。
三、技術(shù)參數(shù)(典型值)
產(chǎn)品名稱(chēng):CY3-假尿苷
英文名稱(chēng):Cy3-Pseudouridine
分子類(lèi)型:熒光標(biāo)記核苷
激發(fā)波長(zhǎng)(Ex):約550 nm
發(fā)射波長(zhǎng)(Em):約570 nm
外觀:紅色或橙紅色粉末
溶解性:可溶于DMSO、無(wú)菌水或緩沖液
儲(chǔ)存條件:-20℃避光保存
穩(wěn)定性:干燥避光條件下穩(wěn)定保存12個(gè)月以上
四、應(yīng)用領(lǐng)域
RNA定位研究
將CY3-假尿苷摻入RNA分子中,可在細(xì)胞內(nèi)追蹤RNA的轉(zhuǎn)運(yùn)、定位與降解過(guò)程。
RNA結(jié)構(gòu)與功能研究
用于分析假尿苷修飾對(duì)RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性及翻譯效率的影響。
體外轉(zhuǎn)錄體系標(biāo)記
在T7或SP6 RNA聚合酶體系中摻入標(biāo)記核苷,合成熒光RNA探針。
RNA-蛋白互作分析
結(jié)合免疫共沉淀或FRET技術(shù)研究RNA與蛋白質(zhì)之間的相互作用。
多色熒光成像
與其他熒光標(biāo)記核苷聯(lián)合使用,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)RNA多重可視化分析。
五、使用方法建議
溶解
使用無(wú)水DMSO或無(wú)RNA酶水溶解,制備高濃度儲(chǔ)備液(如1–10 mM),分裝避光保存。
摻入比例
在體外轉(zhuǎn)錄體系中,建議與UTP按一定比例(如5–20%替代比例)混合,以優(yōu)化摻入效率和熒光強(qiáng)度。
細(xì)胞轉(zhuǎn)染
將標(biāo)記RNA通過(guò)脂質(zhì)體或電轉(zhuǎn)方式導(dǎo)入細(xì)胞,避免強(qiáng)光照射。
檢測(cè)設(shè)置
熒光顯微鏡使用TRITC或Cy3濾光片組;流式細(xì)胞儀使用561 nm激發(fā)通道。
六、注意事項(xiàng)
操作全程應(yīng)避免RNase污染。
CY3對(duì)光敏感,實(shí)驗(yàn)過(guò)程需避光。
高比例替代可能影響RNA結(jié)構(gòu),建議進(jìn)行梯度優(yōu)化。
本產(chǎn)品僅限科研用途,不可用于臨床**。
七、儲(chǔ)存與運(yùn)輸
產(chǎn)品應(yīng)在-20℃條件下避光保存,運(yùn)輸建議采用低溫冷鏈。避免反復(fù)凍融,建議分裝儲(chǔ)存。
八、產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)總結(jié)
CY3-假尿苷將假尿苷這一重要RNA修飾分子與高性能花青素類(lèi)熒光染料相結(jié)合,為RNA修飾研究與細(xì)胞成像提供了高靈敏度、可視化的實(shí)驗(yàn)工具。其良好的光學(xué)性能與較高的生物相容性,使其在RNA結(jié)構(gòu)研究、轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析以及分子影像學(xué)研究中具有廣闊應(yīng)用前景。
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